[发明专利]一种基于外泌体miRNA和单细胞核转录组联合的细胞-miRNA-细胞网络构建方法及系统在审
| 申请号： | 202310304174.6 | 申请日： | 2023-03-27 |
| 公开（公告）号： | CN116403640A | 公开（公告）日： | 2023-07-07 |
| 发明（设计）人： | 公光业;林博;殷昊;张志明;肖云平 | 申请（专利权）人： | 上海欧易生物医学科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;G16B25/10;G16B30/00 |
| 代理公司： | 上海德禾翰通律师事务所 31319 | 代理人： | 侯莉 |
| 地址： | 201114 上海市*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种同一组织外泌体miRNA和单细胞核转录组数据联合分析，以获取miRNA介导的细胞群调控网络的方法。通过鉴定单细胞核转录组数据中primarymiRNA及其在mRNA细胞类群中的表达数据，可获得上游细胞和miRNA关系对；通过关联外泌体miRNA表达数据、单细胞mRNA表达数据，可获得miRNA和下游细胞类型gene(mRNA)关系对；最后基于前两种方法结果和单细胞转录组细胞通讯数据，可构建完整上游细胞‑miRNA‑下游细胞功能互作调控网络，为鉴定特定miRNA的来源细胞类型以及下游调控细胞类型，明确不同细胞类型之间的互作与调控提供了数据支持。实现从实验到生物信息分析的同一组织外泌体miRNA测序分析及单细胞核测序分析的完整技术方案。本发明还公开了实现上述方法的系统及方法的应用。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 外泌体 mirna 细胞核 转录 联合 细胞 网络 构建 方法 系统 | ||
【主权项】：
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