[发明专利]基因焦点扩增分型模型的构建方法及肿瘤样本的分型方法在审

专利信息
申请号: 202211067952.6 申请日: 2022-09-01
公开(公告)号: CN115148287A 公开(公告)日: 2022-10-04
发明(设计)人: 徐瑞华;赵齐;王诗翔 申请(专利权)人: 中山大学肿瘤防治中心(中山大学附属肿瘤医院;中山大学肿瘤研究所)
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00;G06K9/62;G16B40/20;G16H50/20
代理公司: 北京市万慧达律师事务所 11111 代理人: 谢敏楠;贺英倩
地址: 510060 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 本申请涉及一种基因焦点扩增分型模型的构建方法、肿瘤样本的分型方法、基因焦点扩增分型模型的构建装置、肿瘤样本的分型系统、计算机设备和存储介质。所述方法包括:获取预设数量肿瘤样本中各等位基因特异的第一关联特征样本数据;对各第一关联特征样本数据进行随机划分处理,生成训练样本集和测试样本集;根据训练样本集对预设的基因分型模型进行训练,并根据测试样本集对基因分型模型进行测试,基于训练和测试得到的PR‑AUC指标调整基因分型模型的模型参数,直至PR‑AUC指标符合预设要求,生成训练好的基因焦点扩增分型模型,以基于训练好的基因焦点扩增分型模型输出基因焦点扩增分型结果。采用本方法能够准确地预测基因是否载于ecDNA。
搜索关键词: 基因 焦点 扩增 模型 构建 方法 肿瘤 样本
【主权项】:
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