[发明专利]基因组组装方法、装置、设备及存储介质有效
| 申请号: | 202210311761.3 | 申请日: | 2022-03-28 |
| 公开(公告)号: | CN114694755B | 公开(公告)日: | 2023-01-24 |
| 发明(设计)人: | 王莹;卢宇彤;陈志广 | 申请(专利权)人: | 中山大学 |
| 主分类号: | G16B30/20 | 分类号: | G16B30/20;G16B20/00 |
| 代理公司: | 深圳市世纪恒程知识产权代理事务所 44287 | 代理人: | 薛福玲 |
| 地址: | 510275 *** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | 本申请公开了一种基因组组装方法、装置、设备及存储介质,包括:获取基因短序列,以及确定第一分割值;基于所述第一分割值,将所述基因短序列进行分割,得到各基因子序列;基于预设分组并行正则采样排序算法,对各所述基因子序列进行全局排序,得到各排序基因子序列;基于各所述排序基因子序列,构建分布式基因图;并行遍历所述分布式基因图,得到各连续基因序列,并对各所述连续基因序列进行填充组装,得到各目标连续基因序列;确定第二分割值,若所述第二分割值大于预设最大分割阈值,则将各所述目标连续基因序列进行组装,得到基因组组装结果。本申请解决了基因组组装计算复杂度高导致组装效率低的技术问题。 | ||
| 搜索关键词: | 基因组 组装 方法 装置 设备 存储 介质 | ||
【主权项】:
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