[发明专利]用于布尼亚相关病毒属种分类的自动识别方法及系统在审
| 申请号: | 202111610163.8 | 申请日: | 2021-12-27 |
| 公开(公告)号: | CN114334010A | 公开(公告)日: | 2022-04-12 |
| 发明(设计)人: | 李娟;史卫峰;姚雪;田忠帅;姬敬开 | 申请(专利权)人: | 山东第一医科大学(山东省医学科学院) |
| 主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B50/30;G16B50/10;G16B30/00 |
| 代理公司: | 北京秉文同创知识产权代理事务所(普通合伙) 11859 | 代理人: | 张文武;孙富利 |
| 地址: | 271000 山*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | 本发明涉及一种用于布尼亚相关病毒属种分类的自动识别方法及系统,该方法包括:从Taxonomy数据库链接到的GenBank数据库中获取布尼亚相关病毒的所有蛋白基因组序列的FASTA格式文件;基于NCBI登录号利用CDD工具对FASTA格式文件进行批量注释并生成布尼亚病毒目RdRp核心保守域序列数据包;安装BLAST工具和CDD工具并搭建自动识别网页;获取用户在自动识别网页提交的待识别病毒序列;利用CDD工具对待识别病毒序列进行筛查,从待识别病毒序列中提取出布尼亚病毒目RdRp核心保守域序列;利用BLAST工具从BLAST本地库中获取多条相似序列的分类信息,该方法可快速获取病毒分类信息。 | ||
| 搜索关键词: | 用于 布尼亚 相关 病毒 分类 自动识别 方法 系统 | ||
【主权项】:
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