[发明专利]基于宏基因组拼接错误的检测校正系统在审
| 申请号： | 202111451194.3 | 申请日： | 2021-12-01 |
| 公开（公告）号： | CN114155914A | 公开（公告）日： | 2022-03-08 |
| 发明（设计）人： | 赵兴明;赖森莹 | 申请（专利权）人： | 复旦大学 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B30/20;G16B20/20;G16B40/00 |
| 代理公司： | 合肥正则元起专利代理事务所(普通合伙) 34160 | 代理人： | 杨润 |
| 地址： | 200433 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了基于宏基因组拼接错误的检测校正系统，涉及基因组测序拼接技术领域，解决了由于高通量测序数据的通量高，序列短，噪声大的特点，这就导致基因组的组装结果通常会引入组装错误，而组装错误也给下游分析带来影响的问题，通过利用提取的contig水平的相关特征建立的样本特征矩阵预测可能存在组装错误的contig，利用提取的短窗口水平的相关特征建立的窗口特征矩阵在基于无监督的预测方法下得到组装错误所在的具体位点；在预测到的组装错误所在具体位点处进行contig打断，从而进行校正，便能够检测出宏基因组组装的重叠群中的组装错误并进行校正，从而降低组装过程中引入的错误，提高组装结果的准确性。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 宏基 拼接 错误 检测 校正 系统 | ||
【主权项】：
暂无信息
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