[发明专利]一种基于回归的性能优异的疾病和miRNA关联预测方法在审

专利信息
申请号: 202111387787.8 申请日: 2021-11-22
公开(公告)号: CN114171124A 公开(公告)日: 2022-03-11
发明(设计)人: 王树林;陈嘉 申请(专利权)人: 湖南大学
主分类号: G16B40/20 分类号: G16B40/20;G06N3/08
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 410082 湖南省*** 国省代码: 湖南;43
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摘要: 发明涉及生物信息学中的数据挖掘领域,具体涉及一种基于回归的性能优异的miRNA与疾病关联预测方法。其发明内容主要包括:(1)数据集的收集和处理;(2)构建疾病语义相似性矩阵SS、miRNA功能相似性矩阵FS、疾病/miRNA高斯相互作用轮廓核相似性矩阵KD和KM以及疾病/miRNA综合相似性矩阵SD和SM;(3)利用嵌入层的概念,利用回归模型训练嵌入层,将一种疾病/miRNA映射成一个特征向量;(4)利用k均值聚类挑选负样本;(5)构建BP神经网络并训练;(6)利用训练好的BP神经网络做预测;(7)利用dbDEMC数据库验证预测结果的准确性。和现有的技术相比,本发明提供了一种基于回归提取特征向量,并用k均值聚类提取负样本以识别未知的疾病‑miRNA关联,具有更强的鲁棒性。本发明的方法可行且有效,在预测miRNA与疾病关联方方面能取得良好的效果,对于疾病/miRNA特征向量的提取的发展具有重要意义。
搜索关键词: 一种 基于 回归 性能 优异 疾病 mirna 关联 预测 方法
【主权项】:
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