[发明专利]一种跨物种编码多肽sORF的预测方法在审
| 申请号： | 202111305379.3 | 申请日： | 2021-11-05 |
| 公开（公告）号： | CN114154396A | 公开（公告）日： | 2022-03-08 |
| 发明（设计）人： | 郭丽;姜雯雯;夏道良 | 申请（专利权）人： | 南京邮电大学 |
| 主分类号： | G06F30/27 | 分类号： | G06F30/27;G06K9/62;G06F119/02 |
| 代理公司： | 南京纵横知识产权代理有限公司 32224 | 代理人： | 刘妍妍 |
| 地址： | 210003 *** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明属于生物信息领域，公开了一种跨物种编码多肽sORF的预测方法，整合了sORF数据库中人和小鼠、TAIR数据库中拟南芥以及NCBI数据库中部分原核生物的可编码蛋白的DNA序列，并通过数据过滤策略和负样本产生策略构建各物种相应的正负样本；提取序列特征，并利用最大相关最小冗余和增量选择的方法对训练集进行特征筛选，得到不同方法对应的最佳特征集，构建肽编码sORF预测模型；利用贪婪的网格搜索方法进行参数优化，构建基于支持向量机的最佳预测模型，并通过灵敏度、特异度、准确率和马修斯相关系数对预测模型经行评估。本方法有助于分类识别肽编码sORFs，对肽编码sORFs的研究和基因注释有重要意义。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 物种 编码 多肽 sorf 预测 方法 | ||
【主权项】：
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