[发明专利]一种q-HMM和规则相结合的蛋白质二级结构预测方法在审

专利信息
申请号: 202110978944.6 申请日: 2021-08-25
公开(公告)号: CN115732029A 公开(公告)日: 2023-03-03
发明(设计)人: 唐千清;张琬沁;张雨柔;姚洪亮;姚洪达 申请(专利权)人: 南京理工大学
主分类号: G16B15/00 分类号: G16B15/00
代理公司: 南京理工大学专利中心 32203 代理人: 汪清
地址: 210094 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种q‑HMM和规则相结合的蛋白质二级结构预测方法,首先建立q‑HMM并利用关联规则优化模型,然后训练q‑HMM参数,使用模型参数进行预测,最后得出预测的蛋白质二级结构链。本发明将经典HMM改进为q‑HMM,建立了适用于蛋白质二级结构预测的双向q‑HMM,同时考虑了邻近的氨基酸一级结构和二级结构的影响,弥补了经典HMM固有的时序特性的缺陷;使用q‑HMM的同时融入了规则以提高模型预测的准确度,双向预测提高了计算速度,同时也弥补了规则预测的不足。
搜索关键词: 一种 hmm 规则 相结合 蛋白质 二级 结构 预测 方法
【主权项】:
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