[发明专利]一种对协同致死的癌症驱动基因进行预测的方法在审
| 申请号： | 202110661881.1 | 申请日： | 2021-06-15 |
| 公开（公告）号： | CN113362894A | 公开（公告）日： | 2021-09-07 |
| 发明（设计）人： | 韦嘉;吴金波 | 申请（专利权）人： | 上海基绪康生物科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B20/50 | 分类号： | G16B20/50;G16B30/00;G16B25/00 |
| 代理公司： | 武汉智新达知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 42272 | 代理人： | 何春阳 |
| 地址： | 200000 上海市浦东新区*** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种对协同致死的癌症驱动基因进行预测的方法，包括以下步骤：S1：从COSMIC和MetaCore中收集癌症生物标记，将其用作筛选原始癌症相关SL对的筛选器；S2：从酵母SL对中产生阳性SL对，然后进行同源基因转化；S3：基于候选基因和癌症网络内的基因组成原始候选SL对；S4：进行卡方检验用来评估两个基因的突变是否是每个原始候选SL对中的独立事件；S5：对候选SL对和阳性SL对的三个特征进行了计算和归一化。该方法通过设计一个基于学习的管道，根据已知的SL基因对以及其他未知基因对新的SL基因对进行排序，通过挖掘累积的TCGA突变和基因表达数据，以及蛋白质‑蛋白质相互作用网络中的基因特性，将传统策略整合。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 协同 致死 癌症 驱动 基因 进行 预测 方法 | ||
【主权项】：
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