[发明专利]一种基于机器学习的新冠病毒亚群识别方法在审
申请号: | 202110630187.3 | 申请日: | 2021-06-07 |
公开(公告)号: | CN113990390A | 公开(公告)日: | 2022-01-28 |
发明(设计)人: | 肖勉丽;胡伟澎;石景容 | 申请(专利权)人: | 重庆南鹏人工智能科技研究院有限公司;广州天鹏计算机科技有限公司 |
主分类号: | G16B20/50 | 分类号: | G16B20/50;G16B30/10 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 401120 重庆市渝北区*** | 国省代码: | 重庆;50 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于机器学习的新冠病毒亚群识别方法,包括收集需要分析的病毒基因序列,然后,根据规则去除质量较低的序列,清理数据后,使用比对软件把序列与参考序列进行比对,从比对结果可以获得突变位点,对突变位点进行编码后,使用t‑SNE把矩阵投影到二维平面上,然后使用DBSCAN进行聚类,最后排除掉无法聚类的噪点,就能得到相互区分开的病毒群。本发明开发一种基于新冠病毒的突变位点进行自动分群的方法,相对于传统方法,该方法消耗的计算资源较少,且分析速度较快,能够提高病毒群划分的粒度,从而增强发现病毒亚群的能力,增强分群方法的稳健性,尽可能使具有相同模式序列的病毒划分为同一个群体,具有不同模式序列的病毒群区别开来。 | ||
搜索关键词: | 一种 基于 机器 学习 病毒 识别 方法 | ||
【主权项】:
暂无信息
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