[发明专利]棉花全基因组40K单核苷酸位点及其在棉花基因分型中的应用

摘要

本发明提供了一种棉花全基因组40K单核苷酸位点及其在棉花基因分型中的应用，其中棉花全基因组40K单核苷酸位点通过基于三个群体重测序获得的VCF文件，以棉花基因组TM‑1_V2.1为参考，对数据中的位点信息进行初步筛选目标区段，然后再合成目标区段对应的探针。通过选取13个棉花品种进行数据测试，选取13个陆地棉材料，包括1个野生种、1个半野生种和11个栽培种进行芯片检测。根据检测结果，优先挑选均一性好的目标区域，并保证整体的均匀分布。最终筛选获得40K单核苷酸位点。本发明位点的应用可以极大提高基因型检测准确度、提高检测水平，降低检测成本，并为棉花分子育种提供重要的技术支撑。