[发明专利]一种T细胞受体序列motif组合识别检测方法、存储介质及设备有效
申请号: | 202110536816.6 | 申请日: | 2021-05-17 |
公开(公告)号: | CN113380324B | 公开(公告)日: | 2023-06-27 |
发明(设计)人: | 王嘉寅;何欣诺;朱晓燕;秦秀昕;徐颖;张选平;赖欣 | 申请(专利权)人: | 西安交通大学 |
主分类号: | G16B20/50 | 分类号: | G16B20/50;G16B30/10;G16B40/00 |
代理公司: | 西安通大专利代理有限责任公司 61200 | 代理人: | 高博 |
地址: | 710049 *** | 国省代码: | 陕西;61 |
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摘要: | 本发明公开了一种T细胞受体序列motif组合识别检测方法、存储介质及设备,构建Tumor‑Health矩阵和Tissue‑Blood矩阵作为输入矩阵;以motif组合的类内类间距离可分性作为优化目标函数;设计双种群遗传算法,对输入矩阵中的每一motif列和label列进行相关性分析,采用点二列相关性作为衡量motif列和label列是否相关的指标;以优化目标函数作为算法优化目标,利相关性指标对输入矩阵的motif进行初步筛选,过滤掉不相关的motif列,通过遗传算法进行迭代计算,得到两组种群的优势解,取两组种群中适应度排前三的染色体作为最优解,并解码成为对应的motif集合,取对应集合的交集作为最终挖掘出的motif,完成识别检测。本发明能够为免疫治疗提供可能的生物标志物研究方向。 | ||
搜索关键词: | 一种 细胞 受体 序列 motif 组合 识别 检测 方法 存储 介质 设备 | ||
【主权项】:
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