[发明专利]一种基于分子相似性和半监督学习的药物虚拟筛选方法和装置有效

专利信息
申请号: 202110478484.0 申请日: 2021-04-29
公开(公告)号: CN113192572B 公开(公告)日: 2022-08-23
发明(设计)人: 吴建盛;徐华健;胡海峰;朱燕翔 申请(专利权)人: 南京邮电大学
主分类号: G16C20/50 分类号: G16C20/50;G16C20/70;G16C20/90;G06K9/62
代理公司: 南京苏科专利代理有限责任公司 32102 代理人: 范丹丹
地址: 210046 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明揭示了一种基于分子相似性和半监督学习的药物虚拟筛选方法和装置,该方法包括以下步骤:S1:收集数据集,得到有生物活性值的配体分子样本和无生物活性值的配体分子样本;S2:使用S1步骤中得到的有生物活性值的配体分子样本构建回归模型;S3:计算数据集中分子间的相似度;S4:利用S3步骤中得到的分子相似度和S2步骤中得到的回归模型,计算三元组损失;S5:根据S2步骤和S4步骤得到的损失函数训练模型。基于半监督学习方法,在模型训练中引入大量的无实验生物活性值样本,使用分子相似度和三元组损失对无实验生物活性值样本的模型预测值进行约束,解决实际应用场景中大量无生物活性值的样本无法有效参与模型训练的难题。
搜索关键词: 一种 基于 分子 相似性 监督 学习 药物 虚拟 筛选 方法 装置
【主权项】:
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