[发明专利]一种使用短读长序列纠错长读长组装结果的方法和装置在审

专利信息
申请号: 202110452532.9 申请日: 2021-04-26
公开(公告)号: CN113012758A 公开(公告)日: 2021-06-22
发明(设计)人: 邓天全;杨林峰 申请(专利权)人: 武汉华大基因技术服务有限公司
主分类号: G16B30/00 分类号: G16B30/00;G16B50/00
代理公司: 深圳鼎合诚知识产权代理有限公司 44281 代理人: 李小焦;彭家恩
地址: 430075 湖北省武汉市武汉东湖新技术开发区高*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 本申请公开了一种使用短读长序列纠错长读长组装结果的方法和装置。本申请的方法包括,切割步骤,以固定阈值对长读长组装结果进行切分,获得切分后的长读长组装结果;以及后续的基于切分后的长读长组装结果进行的长读长组装结果建库步骤、比对步骤、比对结果匹配步骤、比对结果转换和排序步骤、比对结果建库步骤、长读长组装结果纠错步骤,最终合并纠错结果,获得纠错后的长读长组装结果。本申请的方法,可使用小内存节点进行纠错,大幅降低了内存峰值,解决没有大内存节点无法进行纠错的问题,降低了长度长组装结果的纠错成本;并且,在资源充足情况下,本申请的纠错方法和装置还可以并行执行,降低执行时间,提供纠错效率。
搜索关键词: 一种 使用 短读长 序列 纠错 长读长 组装 结果 方法 装置
【主权项】:
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