[发明专利]一种基于三代PacBio和Hi-C技术组装和注释霍巴藏绵羊基因组的方法在审
| 申请号： | 202110410817.6 | 申请日： | 2021-04-16 |
| 公开（公告）号： | CN113151426A | 公开（公告）日： | 2021-07-23 |
| 发明（设计）人： | 卢曾奎;刘建斌;袁超 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;G16B20/00;C12N15/12 |
| 代理公司： | 北京力量专利代理事务所(特殊普通合伙) 11504 | 代理人： | 戴治娟 |
| 地址： | 730050 甘肃*** | 国省代码： | 甘肃;62 |
| 权利要求书： | 暂无信息 | 说明书： | 暂无信息 |
| 摘要： | 本发明属于生物信息技术领域，具体涉及一种基于三代PacBio和Hi‑C技术组装和注释霍巴藏绵羊基因组的方法，所述方法包括如下步骤：(1)采集霍巴藏绵羊血液和组织样本；(2)构建基因组文库和转录组文库；(3)基因组大小和杂合率评估；(4)基因组组装，利用转录测序结果纠错；(5)Hi‑C辅助组装和评估；(6)基因组注释和评估。本发明组装了霍巴藏绵羊染色体级别的高质量基因组，不仅为藏绵羊种群遗传资源保护与创新利用研究提供了宝贵的基因组资源，而且为进一步研究青藏高原特有畜禽品种的环境适应机制奠定了坚实的基础，为霍巴藏绵羊高寒低氧适应的分子机制研究奠定了基础，同时也为人类缺氧相关疾病的研究提供参考数据。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 pacbio hi 技术 组装 注释 霍巴藏 绵羊 基因组 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
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