[发明专利]一种siRNA敲减mRNA的靶点预测方法和系统在审

专利信息
申请号: 202110397409.1 申请日: 2021-04-14
公开(公告)号: CN113066527A 公开(公告)日: 2021-07-02
发明(设计)人: 冯伟兴;赵明昊;徐南;康立清 申请(专利权)人: 吉优诺(上海)基因科技有限公司
主分类号: G16B15/30 分类号: G16B15/30;G16B30/00
代理公司: 上海市汇业律师事务所 31325 代理人: 王函
地址: 201203 上海市浦东新区中国*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种siRNA敲减mRNA的靶点预测方法,该方法采用:首先提取mRNA目标结合靶点的碱基序列特征,然后提取目标结合靶点处的RNA二级结构特征,进而通过siRNA敲减mRNA的靶点预测模型实现siRNA敲减mRNA的靶点预测。此外,本发明还公开了一种siRNA敲减mRNA的靶点预测系统,包括:输入mRNA序列模块,序列特征提取模块,二级结构特征提取模块和预测模型筛选模块。本发明除了考虑mRNA目标结合靶点及其对应siRNA的碱基序列特征,还考虑了mRNA目标结合靶点处的RNA二级结构特征,有效提高了siRNA敲减mRNA的靶点预测效果。
搜索关键词: 一种 sirna 敲减 mrna 预测 方法 系统
【主权项】:
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