[发明专利]一种单细胞的转录因子调控网络预测方法及装置在审

专利信息
申请号: 202110392600.7 申请日: 2021-04-13
公开(公告)号: CN112992267A 公开(公告)日: 2021-06-18
发明(设计)人: 李昊;陈河兵;孙昱;洪浩;黄昕;陶欢;黄琦雅;伯晓晨 申请(专利权)人: 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院
主分类号: G16B20/00 分类号: G16B20/00;G06N3/04;G06N3/08
代理公司: 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 代理人: 毕翔宇
地址: 100082 *** 国省代码: 北京;11
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摘要: 本申请提供了一种单细胞的转录因子调控网络预测方法及装置,其中,所述方法包括:获取scATAC‑seq数据,其中,scATAC‑seq数据包括峰值区域‑细胞矩阵;对峰值区域‑细胞矩阵进行初始化处理,分别得到表征转录因子之间的调控关系的初始邻接矩阵,以及表征每个转录因子的特征信息的初始特征矩阵;将初始邻接矩阵和初始特征矩阵输入至转录因子调控网络预测模型中,得到与初始邻接矩阵相对应的邻接矩阵预测结果。这样一来,仅通过采用scATAC‑seq数据即可解决单细胞的转录因子调控网络预测问题,规避了scRNA‑seq数据在预测调控关系时的诸多弊端,使得转录因子调控网络预测的准确率较高。
搜索关键词: 一种 单细胞 转录 因子 调控 网络 预测 方法 装置
【主权项】:
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