[发明专利]一种基于结构特征的DNA绑定残基预测方法

摘要

一种基于结构特征的DNA绑定残基预测方法，首先，根据输入的待进行DNA绑定残基预测的蛋白质结构信息，以任一残基为球心，R为半径，通过以下四步获取该残基的特征向量：1)统计该球内20种常见类型残基出现的频率，记作2)统计该球内三类二级结构类别的残基出现的频率，记作3)统计该球内三类溶剂可及性类别的残基出现的频率，记作4)将步骤1)至3)中的串联成一个特征向量；然后，构建样本集并训练所搭建的一维卷积神经网络；最后，将蛋白质结构中残基的特征向量输入训练的模型中，根据模型输出概率是否大于阈值threshold，进而判断对应残基是否为DNA绑定残基。本发明计算代价小、预测精度高。