[发明专利]一种过滤全长转录本的方法和系统在审
| 申请号: | 202011619487.3 | 申请日: | 2020-12-30 |
| 公开(公告)号: | CN114694751A | 公开(公告)日: | 2022-07-01 |
| 发明(设计)人: | 封力;汤冬;刘山林;梁帆;汪德鹏 | 申请(专利权)人: | 武汉希望组生物科技有限公司 |
| 主分类号: | G16B25/00 | 分类号: | G16B25/00;G16B30/10;G16B40/00 |
| 代理公司: | 武汉河山金堂专利事务所(普通合伙) 42212 | 代理人: | 胡清堂 |
| 地址: | 430000 湖北省武汉市东湖新技术开*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | 本发明公开了一种过滤全长转录本的方法和系统,所述方法包括以下步骤:将测序获得的转录本读段与参考基因组进行比对,根据转录本剪切模式,进行聚类去冗余;根据平均测序深度、外显子支持数以及转录本读段支持数进行过滤;再与参考基因组重比对,再次聚类去冗余。所述系统用于执行所述过滤方法。本发明提供的方法和系统能够针对性的处理参考基因组中未知剪切模式的转录本,有效保留低丰度可信转录本,且过滤结果相较于现有技术均具备较高的灵敏性和准确性。 | ||
| 搜索关键词: | 一种 过滤 全长 转录 方法 系统 | ||
【主权项】:
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