[发明专利]一种利用DNA亲和蛋白测序鉴定棉花纤维发育时期转录因子结合元件的方法在审

专利信息
申请号: 202011449922.2 申请日: 2020-12-09
公开(公告)号: CN112646867A 公开(公告)日: 2021-04-13
发明(设计)人: 韦洋洋;程爽;刘玉玲;敖国威;金丽英;陈悦;邵静;孟飞;商海红;王雪飞;彭仁海 申请(专利权)人: 安阳工学院;郑州大学
主分类号: C12Q1/6869 分类号: C12Q1/6869;G01N33/53;G16B20/30
代理公司: 北京易捷胜知识产权代理事务所(普通合伙) 11613 代理人: 齐胜杰
地址: 455000 河南省*** 国省代码: 河南;41
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摘要: 发明涉及一种用DNA亲和蛋白测序鉴定棉花纤维发育时期转录因子结合元件的方法,其包括1)提取棉花纤维基因组DNA,进行随机打断为200bp左右片段后,利用打断的DNA构建具有测序接头的Index‑DNA文库;2)原核表达带有标签的棉花转录因子蛋白,并进行免疫印迹确认所表达的目标蛋白;3)将目标蛋白与Index‑DNA文库在体外孵育使两者充分结合,并提取与该蛋白特异结合的Index‑DNA;4)进行扩增后测序,将所得数据进行匹配到棉花基因组上,并与棉花纤维发育时期的DHS位点相互对应后,识别确认所得结合元件序列。本发明的方法不经遗传转化,可以迅速准确的鉴定出棉花转录因子下游结合位点,具有快速、准确、经济、省力等优点。
搜索关键词: 一种 利用 dna 亲和 蛋白 鉴定 棉花 纤维 发育 时期 转录 因子 结合 元件 方法
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