[发明专利]一种利用DNA亲和蛋白测序鉴定棉花纤维发育时期转录因子结合元件的方法在审
申请号: | 202011449922.2 | 申请日: | 2020-12-09 |
公开(公告)号: | CN112646867A | 公开(公告)日: | 2021-04-13 |
发明(设计)人: | 韦洋洋;程爽;刘玉玲;敖国威;金丽英;陈悦;邵静;孟飞;商海红;王雪飞;彭仁海 | 申请(专利权)人: | 安阳工学院;郑州大学 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;G01N33/53;G16B20/30 |
代理公司: | 北京易捷胜知识产权代理事务所(普通合伙) 11613 | 代理人: | 齐胜杰 |
地址: | 455000 河南省*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | 本发明涉及一种用DNA亲和蛋白测序鉴定棉花纤维发育时期转录因子结合元件的方法,其包括1)提取棉花纤维基因组DNA,进行随机打断为200bp左右片段后,利用打断的DNA构建具有测序接头的Index‑DNA文库;2)原核表达带有标签的棉花转录因子蛋白,并进行免疫印迹确认所表达的目标蛋白;3)将目标蛋白与Index‑DNA文库在体外孵育使两者充分结合,并提取与该蛋白特异结合的Index‑DNA;4)进行扩增后测序,将所得数据进行匹配到棉花基因组上,并与棉花纤维发育时期的DHS位点相互对应后,识别确认所得结合元件序列。本发明的方法不经遗传转化,可以迅速准确的鉴定出棉花转录因子下游结合位点,具有快速、准确、经济、省力等优点。 | ||
搜索关键词: | 一种 利用 dna 亲和 蛋白 鉴定 棉花 纤维 发育 时期 转录 因子 结合 元件 方法 | ||
【主权项】:
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