[发明专利]基于子图-变分自编码结构的分子生成方法

摘要

一种基于子图‑变分自编码结构的分子生成方法，首先挖掘训练集中所有分子的频繁子图集，再通过基于统计的计数阈值与药学性质筛选频繁子图，得到满足条件的分子子图总集S*；对训练集中的每个分子G进行图分解，得到相应的分子子图集合S；将分子集S输入编码器进行编码，得到相应的隐空间向量Z；最后将Z输入解码器进行解码，得到重构的分子G′，本发明克服了传统逐原子生成方法带来的化学特性缺失和难以合成等缺点，通过子结构的应用保证了分子的某些化学性质，进而生成化学性质稳定并且易于合成的分子结构，为新型药物小分子的发现与设计带来极大的便利，降低了相关工作人员对领域知识的依赖，提高了新型药物设计和开发的效率，缩短研发周。