[发明专利]一种植物与病原菌蛋白质相互作用的预测方法在审
| 申请号： | 202011020892.3 | 申请日： | 2020-09-25 |
| 公开（公告）号： | CN112185459A | 公开（公告）日： | 2021-01-05 |
| 发明（设计）人： | 张利达;郑存俭;刘源;孙方楠 | 申请（专利权）人： | 上海交通大学 |
| 主分类号： | G16B15/30 | 分类号： | G16B15/30;G16B15/20;G16B50/30 |
| 代理公司： | 上海科盛知识产权代理有限公司 31225 | 代理人： | 叶敏华 |
| 地址： | 200240 *** | 国省代码： | 上海;31 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明涉及一种植物与病原菌蛋白质相互作用的预测方法，包括步骤：1)收集宿主‑病原菌蛋白质互作阳性数据；2)收集蛋白质复合体模板空间结构，分析亚基对的互作界面；3)将宿主‑病原菌蛋白质序列进行同源结构建模，获取蛋白质同源空间结构模型；4)将蛋白质同源空间结构与蛋白质复合体模板空间结构进行比对，获取结构特征；5)提取非结构特征；6)基于结构特征和非结构特征，搭建机器学习模型并测试调整，对基因组尺度的水稻‑稻瘟病菌蛋白质互作进行预测。与现有技术相比，本发明充分借助已测定的蛋白质结构数据，及同源、结构域互作等信息，能够有效、快速、简捷地提取植物‑病原菌蛋白质相关互作特征信息。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 植物 病原菌 蛋白质 相互作用 预测 方法 | ||
【主权项】：
暂无信息
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于上海交通大学，未经上海交通大学许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/202011020892.3/，转载请声明来源钻瓜专利网。
