[发明专利]一种基于序列模板的配体绑定残基预测方法

摘要

一种基于序列模板的配体绑定残基预测方法，首先，根据输入待进行配体绑定残基预测的蛋白质序列信息，其残基个数为L，使用HHblits程序获取包含M条序列的多序列联配信息；然后，分别提取这M条序列的PSSM、SA、PSS、DA特征并按行合并以上特征矩阵生成对应的二维矩阵，将这M条序列的二维特征矩阵扩展为一个特征张量；其次，搭建深度卷积神经网络并利用已知绑定残基的蛋白质序列生成对应的特征张量对该网络进行训练；最后，将待预测的蛋白质序列生成的特征张量输入到训练好的深度卷积神经网络模型中，预测蛋白质序列中的残基是否为绑定残基。