[发明专利]一种基于多尺度注意力卷积神经网络的RNA结合蛋白预测方法及装置有效

专利信息
申请号: 202010571759.0 申请日: 2020-06-22
公开(公告)号: CN111798921B 公开(公告)日: 2022-08-05
发明(设计)人: 杜博;刘子翼;罗甫林 申请(专利权)人: 武汉大学
主分类号: G16B5/20 分类号: G16B5/20;G16B15/20;G16B20/30;G16B40/00;G06N3/04
代理公司: 武汉科皓知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 42222 代理人: 罗飞
地址: 430072 湖*** 国省代码: 湖北;42
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摘要: 发明公开了一种基于多尺度注意力卷积神经网络的RNA结合蛋白预测方法,包括训练阶段和预测阶段。训练阶段包括RNA数据的预处理,RNA数据的编码,构建神经网络和网络参数训练。通过将RNA的数学抽象的统计模式转化成矩阵的形式,输入到预先设计好的基于注意力机制的多尺度卷积神经网络,通过使设计的特别交叉熵损失函数最小,使用Adam优化方法训练神经网络中的参数。在预测阶段,以四个碱基为基本单元的RNA序列数据被输入到网络中,神经网络最后一层输出RNA数据中是否有结合蛋白对应的结合位点的概率大小,从而获得对RNA序列类别的预测结果。本发明可以提高预测精度。
搜索关键词: 一种 基于 尺度 注意力 卷积 神经网络 rna 结合 蛋白 预测 方法 装置
【主权项】:
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