[发明专利]从差异网络中识别驱动基因的方法有效

专利信息
申请号: 202010461333.X 申请日: 2020-05-27
公开(公告)号: CN111816246B 公开(公告)日: 2023-01-10
发明(设计)人: 谢江;杨伏长;王娇 申请(专利权)人: 上海大学
主分类号: G16B5/20 分类号: G16B5/20;G16B20/00
代理公司: 贵州派腾知识产权代理有限公司 52114 代理人: 唐斌
地址: 200444*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种识别差异网络中驱动基因的方法,其特征在于:给定两个代表两种生物状态的基因调控网络,首先量化网络中边的不确定性,然后计算网络中任意两个节点之间最强且最稳定的调控关系,再后将节点特征化表示为网络流的分布,最后量化每个基因在两个网络中的网络流分布差异以识别驱动基因。该方法区别于其他已有的差异网络分析方法,其主要贡献在于结合了网络流和信息熵来刻画网络拓扑的差异。这种结合的优势在于能够量化基因调控网络中边的不确定性,同时能够捕获网络中全面的拓扑特征(局部和全局、线性和非线性特征),因此,能够达到更高的驱动基因识别准确性和健壮性。
搜索关键词: 差异 网络 识别 驱动 基因 方法
【主权项】:
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