[发明专利]从差异网络中识别驱动基因的方法有效
| 申请号: | 202010461333.X | 申请日: | 2020-05-27 |
| 公开(公告)号: | CN111816246B | 公开(公告)日: | 2023-01-10 |
| 发明(设计)人: | 谢江;杨伏长;王娇 | 申请(专利权)人: | 上海大学 |
| 主分类号: | G16B5/20 | 分类号: | G16B5/20;G16B20/00 |
| 代理公司: | 贵州派腾知识产权代理有限公司 52114 | 代理人: | 唐斌 |
| 地址: | 200444*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | 本发明公开了一种识别差异网络中驱动基因的方法,其特征在于:给定两个代表两种生物状态的基因调控网络,首先量化网络中边的不确定性,然后计算网络中任意两个节点之间最强且最稳定的调控关系,再后将节点特征化表示为网络流的分布,最后量化每个基因在两个网络中的网络流分布差异以识别驱动基因。该方法区别于其他已有的差异网络分析方法,其主要贡献在于结合了网络流和信息熵来刻画网络拓扑的差异。这种结合的优势在于能够量化基因调控网络中边的不确定性,同时能够捕获网络中全面的拓扑特征(局部和全局、线性和非线性特征),因此,能够达到更高的驱动基因识别准确性和健壮性。 | ||
| 搜索关键词: | 差异 网络 识别 驱动 基因 方法 | ||
【主权项】:
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