[发明专利]基于链置换反应的miRNA探针初筛方法、系统在审
| 申请号： | 202010067668.3 | 申请日： | 2020-01-20 |
| 公开（公告）号： | CN111235230A | 公开（公告）日： | 2020-06-05 |
| 发明（设计）人： | 田捷;马喜波;朱霖 | 申请（专利权）人： | 中国科学院自动化研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/682 | 分类号： | C12Q1/682 |
| 代理公司： | 北京市恒有知识产权代理事务所(普通合伙) 11576 | 代理人： | 郭文浩;尹文会 |
| 地址： | 100190 *** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明属于非编码RNA检测领域，具体涉及一种基于链置换反应的miRNA探针初筛方法、系统，旨在解决基于人工实验的探针的设计和筛选效率、准确率低的问题。本系统方法包括:获取待检测的核酸序列，输入序列由核酸序列5’端toehold和保护序列组成；基于A、T、G、C四种核苷酸随机组成3’端toehold，与保护序列连接生成探针序列，通过信号放大模型进行链置换反应，获取每步链置换反应的反应物序列和生成物序列；依次计算每步链置换反应的摩尔吉布斯自由能；将每步链置换反应的摩尔吉布斯自由能均小于0的探针序列作为筛选结果进行输出。本发明通过链置换反应的信号放大模型大大提高了探针筛选的效率、准确率。 | ||
| 搜索关键词： | 基于 置换反应 mirna 探针 方法 系统 | ||
【主权项】：
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