[发明专利]一种基于多模态内外交叉的蛋白质构象空间采样方法有效

专利信息
申请号: 201910788537.1 申请日: 2019-08-26
公开(公告)号: CN110706739B 公开(公告)日: 2021-10-29
发明(设计)人: 张贵军;赵凯龙;夏瑜豪;刘俊;彭春祥;周晓根 申请(专利权)人: 浙江工业大学
主分类号: G16B5/20 分类号: G16B5/20;G16B20/20;G16B30/10;G06K9/62
代理公司: 杭州斯可睿专利事务所有限公司 33241 代理人: 王利强
地址: 310014 浙江省*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 一种基于多模态内外交叉的蛋白质构象空间采样方法,引入了排挤策略与贪婪搜索策略,模态内交叉和贪婪搜索策略有利于个体向局部极值收敛,而模态外交叉和排挤策略有利于保持种群多样性。初始化种群后,经过不断片段组装,将种群个体分为多个模态集合,当执行模态内交叉时,运用排挤策略对构象进行采样,当执行模态外交叉时,运用贪婪搜索策略对构象进行采样,通过交叉使用两种策略可以较好的解决算法快速收敛和保持多样性的冲突问题。
搜索关键词: 一种 基于 多模态 内外 交叉 蛋白质 构象 空间 采样 方法
【主权项】:
1.一种基于多模态内外交叉的蛋白质构象空间采样方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:/n1)输入预测蛋白质的序列信息,读取序列长度L;/n2)设置参数:种群规模N,迭代次数G
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