[发明专利]一种基于双层偏置搜索的蛋白质结构预测方法有效
| 申请号： | 201910743322.8 | 申请日： | 2019-08-13 |
| 公开（公告）号： | CN110634531B | 公开（公告）日： | 2021-06-18 |
| 发明（设计）人： | 张贵军;夏瑜豪;赵凯龙;刘俊;彭春祥;周晓根 | 申请（专利权）人： | 浙江工业大学 |
| 主分类号： | G16B15/20 | 分类号： | G16B15/20;G16B50/30 |
| 代理公司： | 杭州斯可睿专利事务所有限公司 33241 | 代理人： | 王利强 |
| 地址： | 310014 浙江省*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 一种基于双层偏置搜索的蛋白质结构预测方法，在遗传算法框架下，首先，种群初始化，根据构象的能量高低将其分配到不同的能量区间；然后，根据能量以及空间结构差异性双层选择指标有偏地选择父代和淘汰构象，不仅能够缓解能量函数不精确的问题，而且可以根据有偏采样搜索到结构更为合理的构象，在提高采样效率的同时，提升了预测精度。本发明提供一种预测精度较高的基于双层偏置搜索的蛋白质结构预测方法。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 基于 双层 偏置 搜索 蛋白质 结构 预测 方法 | ||
【主权项】：
1.一种基于双层偏置搜索的蛋白质结构预测方法，其特征在于：所述方法包括以下步骤：/n1)输入目标蛋白质的序列信息；/n2)根据目标蛋白质序列从ROBETTA服务器上获取3片段和9片段的片段库文件；/n3)设置参数：种群规模NP，最大迭代次数G，能量区间划分个数M，温度因子β；/n4)种群初始化：利用Rosetta协议第一阶段产生种群规模为NP的种群C＝{C
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