[发明专利]一种基于Unet和LSTM的3D医学影像识别和分割方法在审

专利信息
申请号: 201910733487.7 申请日: 2019-08-09
公开(公告)号: CN110414481A 公开(公告)日: 2019-11-05
发明(设计)人: 朱思涵;浦剑 申请(专利权)人: 华东师范大学
主分类号: G06K9/00 分类号: G06K9/00;G06K9/34;G06K9/62;G06N3/04;G06T7/11;G16H30/40
代理公司: 上海蓝迪专利商标事务所(普通合伙) 31215 代理人: 徐筱梅;张翔
地址: 200241 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种基于Unet和LSTM的3D医学影像识别和分割方法,包括:医学影像预处理阶段:读取3D格式医学影像,将其按z轴向分解成2D的影像序列,在2D层面对影像数据进行z‑score归一化处理;分割网络训练阶段:使用归一化处理的2D图像序列样本划分训练集进行训练,将U‑net的中间层输出单独取出作为中间变量序列,使用中间变量序列训练LSTM网络;分割网络识别和推断阶段:将样本输入网络获得像素级分割输出,把输出序列合并为3D矩阵获得最终结果。本发明在3D医学影像的识别方面,采用将其分割为2D序列并结合循环网络处理中间变量的方式,降低了计算量,提高了识别工作的效率。
搜索关键词: 医学影像 分割 中间变量 归一化处理 读取 预处理阶段 输出 矩阵获得 输出序列 图像序列 网络获得 网络识别 网络训练 序列训练 循环网络 样本输入 影像数据 影像序列 最终结果 计算量 像素级 训练集 中间层 推断 样本 取出 分解 合并 网络
【主权项】:
1.一种基于Unet和LSTM的3D医学影像识别和分割方法,其特征在于,该方法包括以下具体步骤:步骤1:医学影像预处理读取3D格式医学影像数据,将其按z轴向分解成2D的影像序列,对所述影像序列进行归一化处理;步骤2:分割网络训练所述分割网络包括Unet特征提取部分、LSTM网络部分和Unet上采样部分,以2D影像序列作为输入,输出2D分割结果序列,具体如下:将处理后的2D影像序列样本划分训练集和验证集,将训练集样本输入Unet特征提取部分,将Unet的中间层输出即中间变量单独取出组成中间变量序列,使用中间变量序列输入LSTM网络得到重建中间变量序列,使用重建中间变量序列输入Unet上采样部分得到2D分割结果序列,根据2D分割结果序列计算损失函数,使用梯度回传算法更新Unet和LSTM网络的参数;步骤3:分割网络识别和推断将样本输入分割网络获得2D分割结果序列,把2D分割结果序列合并为3D分割结果输出。
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