[发明专利]基于卷积神经网络的生物组织三维成像方法

摘要

本发明提供了一种基于卷积神经网络的生物组织三维成像方法，通过使用普通的宽场显微镜配合物理切削，获取生物组织的浅层宽场图像，然后利用卷积神经网络将宽场图像转化为清晰的光学层析图像，通过逐层获取生物组织浅层的光学层析图像，最终获得清晰的生物组织三维成像。这种方法不涉及精密的硬件设备和复杂的光路，更加实用和稳定。同时由于宽场拍摄模式具有高通量的特性，因此成像速度更快。

主权项

1.一种基于卷积神经网络的生物组织三维成像方法，其特征在于，包括如下步骤：S1训练卷积神经网络：搭建端到端的卷积神经网络，利用宽场照明显微镜和具有光学层析能力的显微镜对同一样本进行成像，对该样本获得像素一一对齐的宽场图像和光学层析图像，将所述宽场图像和光学层析图像进行拆分，以形成多个宽场图像与光学层析图像的像素一一对应的图像对，然后用拆分后一一对应的图像对训练所述卷积神经网络，以获得训练完成的卷积神经网络；S2样本处理：将待进行成像的生物组织经过包埋处理后形成生物样本进行固定；S3获取浅层的光学层析图像：采用所述步骤S1中的宽场照明显微镜对所述生物样本的浅层进行成像以获得所述浅层的宽场图像，将所述浅层的宽场图像按照所述步骤S1中的宽场图像的尺寸进行拆分后，输入所述步骤S1中训练完成的卷积神经网络中，最终输出同等数量的等同尺寸的光学层析图像，将本次输出的光学层析图像进行拼接以获得所述浅层的光学层析图像；S4获取整个生物样本的光学层析图像：判断是否获得整个生物样本的光学层析图像，未全部获得则将所述已获得光学层析图像的浅层切除以露出新的浅层后重复步骤S3，已全部获得则结束。