[发明专利]基于代谢组学表征颗粒物暴露肺代谢异常标志物筛选的小鼠模型构建方法在审
申请号: | 201910328286.9 | 申请日: | 2019-04-23 |
公开(公告)号: | CN110082443A | 公开(公告)日: | 2019-08-02 |
发明(设计)人: | 申河清;张西;张洁 | 申请(专利权)人: | 中国科学院城市环境研究所;中国科学院大学 |
主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02;A61D7/00 |
代理公司: | 上海科律专利代理事务所(特殊普通合伙) 31290 | 代理人: | 金碎平 |
地址: | 361021 福建*** | 国省代码: | 福建;35 |
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摘要: | 本发明公开了一种基于代谢组学表征颗粒物暴露肺代谢异常标志物筛选的小鼠模型构建方法,其包括如下步骤:S1、对受试小鼠进行PM2.5颗粒的气管滴注,实验周期结束后,收集受试小鼠的肺组织;S2、提取所述对肺组织的代谢物,并利用所述代谢物获得LC‑MS的数据;S3、运用Commonpound Discover软件对所述LC‑MS数据进行离子提取鉴定,再用统计学的方法,对提取结果进行数据处理与模式识别,寻找出PM2.5样品暴露小鼠肺组织代谢组学的生物标志物;S4、运用代谢组学相关数据库和分析软件,构建生物标志物的代谢通路并进行分析。本发明为PM2.5暴露所产生的效应标志物的筛选、评价和应用提供代谢组学方法思路。 | ||
搜索关键词: | 代谢组学 肺组织 小鼠 小鼠模型构建 标志物筛选 生物标志物 代谢异常 代谢物 颗粒物 暴露 代谢通路 分析软件 离子提取 模式识别 实验周期 数据处理 样品暴露 应用提供 标志物 统计学 滴注 构建 气管 数据库 筛选 分析 | ||
【主权项】:
1.一种基于代谢组学表征颗粒物暴露肺代谢异常标志物筛选的小鼠模型构建方法,其特征在于,包括如下步骤:S1、对受试小鼠进行PM2.5颗粒的气管滴注,实验周期结束后,收集受试小鼠的肺组织;S2、提取所述对肺组织的代谢物,并利用所述代谢物获得LC‑MS的数据;S3、运用Commonpound Discover软件对所述LC‑MS数据进行离子提取鉴定,再用统计学的方法,对提取结果进行数据处理与模式识别,寻找出PM2.5样品暴露小鼠肺组织代谢组学的生物标志物;S4、运用代谢组学相关数据库和分析软件,构建生物标志物的代谢通路并进行分析。
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