[发明专利]用于多序列文件的签名-散列在审

专利信息
申请号: 201880022918.2 申请日: 2018-03-28
公开(公告)号: CN110476215A 公开(公告)日: 2019-11-19
发明(设计)人: 约翰·扎卡里·桑伯恩;斯蒂芬·查尔斯·本茨;拉胡尔·帕鲁勒卡尔 申请(专利权)人: 南托米克斯有限责任公司
主分类号: G16B50/30 分类号: G16B50/30
代理公司: 11413 北京柏杉松知识产权代理事务所(普通合伙) 代理人: 王春伟;刘继富<国际申请>=PCT/US
地址: 美国加利*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 使用患者组学数据中已知的SNP位置及其各自的等位基因频率的结果构建代表该患者组学数据的唯一散列。在最优选的方面,针对特定因素(例如,种族,性别等)选择这些已知的SNP位置,并且将等位基因部分以非线性标度的值表示。通常,该散列包括与这些已知的SNP位置和非线性标度相关的标头/元数据,并且进一步包括实际的散列字符串。
搜索关键词: 散列 非线性标度 组学 等位基因频率 等位基因 结果构建 元数据 字符串 标头 优选
【主权项】:
1.一种为组学数据集生成散列的方法,该方法包括:/n在组学数据集中鉴定各个所选位置中的多个单核苷酸多态性(SNP);/n测定该多个SNP的等位基因频率,并基于这些等位基因频率给该多个SNP分配各自的值;并且/n生成输出文件,该输出文件包括该多个SNP的值,并且进一步包括与这些所选位置有关的元数据。/n
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