[发明专利]用于多重态确定的合成多重态在审

专利信息
申请号: 201880019445.0 申请日: 2018-03-20
公开(公告)号: CN110446789A 公开(公告)日: 2019-11-12
发明(设计)人: 范珏;克里斯蒂娜·范;大卫·罗森菲尔德 申请(专利权)人: 赛卢拉研究公司
主分类号: C12Q1/6813 分类号: C12Q1/6813;C12Q1/6869
代理公司: 北京安信方达知识产权代理有限公司 11262 代理人: 李敏春;郑霞
地址: 美国加利*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 本文披露的内容包括用于鉴定多重态表达谱的方法和系统。可以从多个表达谱产生多个合成多重态表达谱。使用经训练的机器学习模型,使用多个合成多重态(例如,双重态)表达谱,可以将表达谱鉴定为单重态或多重态的表达。
搜索关键词: 多重态 表达谱 合成 机器学习模型 单重态 双重态
【主权项】:
1.一种用于鉴定多重态表达谱的方法,所述方法包括:(a)使用多个随机条形码将多个细胞中的多个靶标随机条形码化,以创建针对所述多个细胞中每个细胞的多个随机条形码化的靶标,其中所述多个随机条形码中的每个随机条形码包含细胞标记和分子标记,其中所述多个随机条形码中至少两个随机条形码的分子标记包含不同分子标记序列,并且其中所述多个随机条形码中至少两个随机条形码包含具有相同细胞标记序列的细胞标记;(b)获得所述多个随机条形码化的靶标的测序数据;(c)根据(b)中获得的测序数据,确定与所述多个随机条形码的细胞标记相关联的多个表达谱,其中与所述多个随机条形码的细胞标记中的细胞标记相关联的所述多个表达谱中的表达谱包含具有不同序列的许多分子标记,所述分子标记与所述细胞标记和所述测序数据中多个靶标中的每个靶标相关联;(d)从(c)中确定的与所述多个随机条形码的细胞标记相关联的所述多个表达谱,产生多个合成多重态表达谱;和(e)基于(d)中产生的多个合成双重态表达谱,将与所述多个随机条形码的细胞标记中的细胞标记相关联的所述多个表达谱中的表达谱鉴定为单重态或多重态。
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