[发明专利]一种内分泌干扰物高通量筛选的方法有效
申请号: | 201811529809.8 | 申请日: | 2018-12-14 |
公开(公告)号: | CN109815532B | 公开(公告)日: | 2021-01-19 |
发明(设计)人: | 史薇;谭皓月;陈钦畅;于红霞 | 申请(专利权)人: | 南京大学 |
主分类号: | G06F30/20 | 分类号: | G06F30/20;G16H50/50 |
代理公司: | 江苏瑞途律师事务所 32346 | 代理人: | 蒋海军 |
地址: | 210023 江苏*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明的一种内分泌干扰物高通量筛选模型及筛选方法,涉及内分泌干扰物的虚拟筛选与活性预测领域。本发明针对核受体提取化合物的一级警示结构、二级警示结构以及三级警示结构,再将一级警示结构、二级警示结构和三级警示结构组成核受体高通量筛选模型;再通过核受体高通量筛选模型对目标化合物进行分级警示结构匹配,并进行配体‑受体结合模式分析以及结合活性与干扰活性的半定量预测。本发明克服了现有技术中不能有效地高通量筛查潜在核受体介导的内分泌干扰物的不足,可以对潜在核受体介导的内分泌干扰物进行高通量筛查,并且可以判断出核受体介导的内分泌干扰物的受体竞争活性和拟抗活性。 | ||
搜索关键词: | 一种 内分泌 干扰 通量 筛选 方法 | ||
【主权项】:
1.一种内分泌干扰物高通量筛选模型,其特征在于:针对核受体提取化合物的一级警示结构、二级警示结构以及三级警示结构,其中:基于PubChem fingerprint分子指纹库,利用子结构频率分析和子结构占比分析提取化合物的一级警示结构;利用SARpy软件对满足一级警示结构的化合物进行二级警示结构的提取;利用SARpy软件对同时满足一级警示结构和二级警示结构的化合物进行三级警示结构的提取;上述的一级警示结构、二级警示结构和三级警示结构共同组成核受体高通量筛选模型。
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