[发明专利]判断测序数据饱和的方法、计算机可读介质和应用有效
| 申请号： | 201811490218.4 | 申请日： | 2018-12-06 |
| 公开（公告）号： | CN110232951B | 公开（公告）日： | 2023-08-01 |
| 发明（设计）人： | 贾瑞凯;叶桦;肖芳;郭森;贾延凯;廖国娟 | 申请（专利权）人： | 苏州金唯智生物科技有限公司 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10 |
| 代理公司： | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 | 代理人： | 孙海杰 |
| 地址： | 215000 江苏省苏州市工*** | 国省代码： | 江苏;32 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种判断测序数据饱和的方法、计算机可读介质和应用，涉及测序技术领域。该方法包括如下步骤：(a)提供所述测序数据，所述测序数据为包含X条reads的数据集A；(b)将所述X条reads依据预设的序列相似阈值聚类生成N个Cluster；(c)获得概率Probalility；所述Probalility为抽取第k‑1条reads获得的Cluster数目为i‑1，再抽取一条reads，获得的Cluster数目为i的概率；其中k为小于等于X的正整数，i为小于等于N的正整数；(d)获得衡量数据饱和程度的指标Saturated，所述数据饱和程度指标Saturated越趋近于0，所述测序数据越趋于饱和。该方法可以较为精确的以数值反应测序数据的饱和程度，以使测序数据的饱和度判断更为精准，以保证后续数据分析的准确度。 | ||
| 搜索关键词： | 判断 序数 饱和 方法 计算机 可读 介质 应用 | ||
【主权项】：
1.一种判断测序数据饱和的方法，其特征在于，包括如下步骤：(a)提供所述测序数据，所述测序数据为包含X条reads的数据集A；(b)将所述X条reads依据预设的序列相似阈值聚类生成N个Cluster；(c)获得概率Probalility；所述Probalility为抽取第k‑1条reads获得的Cluster数目为i‑1，再抽取一条reads，获得的Cluster数目为i的概率；其中k为小于等于X的正整数，i为小于等于N的正整数；(d)获得衡量数据饱和程度的指标Saturated，所述数据饱和程度指标Saturated越趋近于0，所述测序数据越趋于饱和；所述数据饱和程度指标Saturated按照公式(Ⅰ)计算得到：![]()
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