[发明专利]一种以STING为靶点的抗炎、抗肿瘤、抗免疫药物的虚拟筛选方法有效
| 申请号: | 201811361065.3 | 申请日: | 2018-11-15 |
| 公开(公告)号: | CN109461474B | 公开(公告)日: | 2022-10-04 |
| 发明(设计)人: | 郭晶晶;王玉宁;董文佩;王洁;许嘉琪;刘小潘;池彦伟;陈长坡;张倩倩 | 申请(专利权)人: | 河南师范大学 |
| 主分类号: | G16B40/00 | 分类号: | G16B40/00;G16B50/00 |
| 代理公司: | 重庆信航知识产权代理有限公司 50218 | 代理人: | 穆祥维 |
| 地址: | 453007 *** | 国省代码: | 河南;41 |
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| 摘要: | 本发明提供了一种以STING为靶点的抗炎、抗肿瘤、抗免疫药物的虚拟筛选方法,包括以下步骤:(1)STING结构准备:从Protein Data Bank数据库中获取STING蛋白晶体结构并进行结构优化;(2)设定活性口袋:以STING蛋白晶体结构中的配体小分子为中心,设定活性口袋;(3)建立待筛选化合物库:从ZINC化合物库选定待筛选小分子,进行3D结构转化和优化,建立多构象的待筛选化合物库;(4)化合物虚拟筛选:物将待筛选化合物库中的化合对接至活性口袋,进行对接打分排序,层层过滤筛选后进行MM/GBSA计算、去重处理和聚类分析,筛选出具有潜在活性的候选化合物。本发明提供的虚拟筛选方法具有快速、高效、低成本等有优点,可缩药物短研发周期,降低经济成本。 | ||
| 搜索关键词: | 一种 sting 肿瘤 免疫 药物 虚拟 筛选 方法 | ||
【主权项】:
1.一种以STING为靶点的抗炎、抗肿瘤、抗免疫药物的虚拟筛选方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)STING结构准备:从Protein Data Bank数据库中获取STING蛋白晶体结构,根据质子化/电荷分配情况进行结构优化;(2)设定活性口袋:以STING蛋白晶体结构中的配体小分子为中心,设定活性口袋;(3)建立待筛选化合物库:从ZINC化合物库选定待筛选小分子,根据原子/键类归属情况,进行3D结构转化和优化,建立多构象的待筛选化合物库;(4)化合物虚拟筛选:将待筛选化合物库中的化合物对接至活性口袋,进行对接打分排序筛选,层层过滤筛选后进行MM/GBSA计算、去重处理和聚类分析,筛选出具有潜在活性的候选化合物。
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