[发明专利]一种乳腺癌疾病功能网络特征分析方法在审
申请号: | 201811127250.6 | 申请日: | 2018-09-27 |
公开(公告)号: | CN109378081A | 公开(公告)日: | 2019-02-22 |
发明(设计)人: | 江振然;陶然 | 申请(专利权)人: | 华东师范大学 |
主分类号: | G16H70/40 | 分类号: | G16H70/40;G16H50/70 |
代理公司: | 上海麦其知识产权代理事务所(普通合伙) 31257 | 代理人: | 董红曼 |
地址: | 200062 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明提供一种基于乳腺癌疾病的功能网络特征分析方法。包括:(1)整合了多种关系网络,包括药物‑疾病网络、药物‑药物网络、药物‑靶点网络、靶点‑靶点网络,并对网络进行了一系列网络拓扑结构性分析。(2)基于乳腺癌功能网络的拓扑结构关系,挖掘出11种可描述药物‑靶点相互作用关系的特征信息。(3)开发了相关的乳腺癌功能网络特征提取工具。本发明方法针对药物重定位这一问题,建立了一种适合乳腺癌疾病特点的功能网络分析方法,并利用该方法预测其潜在靶点和药物新用途,获得了较好的预测效果。 | ||
搜索关键词: | 乳腺癌 靶点 功能网络 网络 结构性分析 药物新用途 关系网络 疾病功能 疾病特点 特征分析 特征提取 特征信息 拓扑结构 网络特征 网络拓扑 重定位 疾病 预测 整合 分析 挖掘 开发 | ||
【主权项】:
1.一种基于乳腺癌的功能网络特征分析方法,其特征在于,具体包括:步骤(1),构建与乳腺癌有关的药物‑疾病网络关系图,首先计算药物‑疾病网络节点之间的最短路径,然后利用路径相加法和路径相减法两种方法构建药物‑疾病关系对的特征,最后结合支持向量机分类器方法对药物‑疾病关系对进行分类预测;步骤(2),构建与乳腺癌有关的药物‑靶点相互作用网络关系图,首先将4种网络关系嵌入到同一网络中,并对该复合网络进行拓扑结构分析;然后根据网络节点之间的关系提出11种描述药物和靶点之间关系的网络结构特征,并根据特征的分布规律预测出具有潜在关系的药物‑靶点对;步骤(3),根据4种网络关系,开发了一种网络特征提取工具;用户只需提交对应的网络关系矩阵就可获得乳腺癌疾病网络中的11种网络结构特征,以供进一步的功能分析。
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