[发明专利]黄鲫高密度SNP标记筛选方法和应用在审
| 申请号： | 201810935589.2 | 申请日： | 2018-08-16 |
| 公开（公告）号： | CN109439739A | 公开（公告）日： | 2019-03-08 |
| 发明（设计）人： | 刘炳舰;柳意樊;吕振明;刘立芹;龚理;江丽华;朱科桦;张伟男;刘珠;段雯 | 申请（专利权）人： | 浙江海洋大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;C12Q1/6888 |
| 代理公司： | 杭州浙科专利事务所(普通合伙) 33213 | 代理人： | 吴秉中 |
| 地址： | 316000 浙江省*** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种黄鲫高密度SNP标记筛选方法，包括提取基因组DNA、RAD文库构建与高通量测序、原始序列数据过滤、SNP信息位点检测与筛选；在提取基因组DNA过程中加入环状DNA和甲壳质，能有效提高SNP标记筛选准确度；在PCR扩增体系过程中加入甲壳质流体，能够提高PCR扩增的反应敏感度从而有助于获得完整的高密度SNP位点；用该方法获得的黄鲫高密度SNP位点可应用于对黄鲫种群进行遗传多样性水平、种群遗传结构等分析。有益效果：本发明获取黄鲫高密度SNP标记位点的方法具有简单、高效、SNP标记筛选准确度高、重复性好、成本低等优点。 | ||
| 搜索关键词： | 筛选 提取基因组DNA 准确度 甲壳质 高通量测序 遗传多样性 数据过滤 文库构建 原始序列 种群遗传 环状DNA 点检测 敏感度 信息位 流体 位点 应用 种群 分析 | ||
【主权项】：
1.黄鲫高密度SNP标记筛选方法，包括提取基因组DNA、RAD文库构建与高通量测序、原始序列数据过滤、SNP信息位点检测与筛选以及群体遗传学分析，其特征在于：所述提取基因组DNA的步骤为：将黄鲫肌肉或鳍条组织样品剪碎，置于提取液I，加入环状DNA和甲壳质，冻融2‑3次，离心，收集上清液后加入提取液II，颠倒混匀后，离心产生白色沉淀，洗涤沉淀得DNA样品，待用。
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