[发明专利]一种具有单碱基分辨率的检测DNA甲基化和单核苷酸变异的测序文库及应用有效
| 申请号： | 201810913924.9 | 申请日： | 2018-08-10 |
| 公开（公告）号： | CN108949945B | 公开（公告）日： | 2021-02-26 |
| 发明（设计）人： | 梁加龙;张坤;滕花景;孙中生 | 申请（专利权）人： | 中国科学院动物研究所 |
| 主分类号： | C40B40/08 | 分类号： | C40B40/08 |
| 代理公司： | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人： | 刘奇 |
| 地址： | 100000 北*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种发夹状的接头以及利用所述发夹状接头同时检测DNA甲基化和单核苷酸变异的方法，属于基因变异检测和表观遗传修饰检测技术领域；所述接头具有如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列，所述发夹状接头的5’至3’方向3位和4位上的胞嘧啶是甲基化修饰的胞嘧啶。所述方法包括以下步骤：基因组DNA片段化后进行末端修复加A尾，连接所述的发夹状接头和甲基化测序接头，重亚硫酸盐转化，PCR扩增，收集扩增产物获得测序文库；测序后进行生物信息学分析获得DNA甲基化和单核苷酸变异位点，本方法可以在只测一套数据的情况下同时精确检测DNA甲基化和单核苷酸变异，可以节省50％的成本。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 具有 碱基 分辨率 检测 dna 甲基化 核苷酸 变异 序文 应用 | ||
【主权项】：
1.一种发夹状的接头，其特征在于，所述发夹状接头具有如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列，所述发夹状接头的5’至3’方向3位和4位上的胞嘧啶是甲基化修饰的胞嘧啶。
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