[发明专利]一种降低单细胞转录组数据中技术噪声的方法有效
| 申请号： | 201810828849.6 | 申请日： | 2018-07-25 |
| 公开（公告）号： | CN109033743B | 公开（公告）日： | 2021-01-01 |
| 发明（设计）人： | 郝洁;邹欣;韩泽广 | 申请（专利权）人： | 上海交通大学 |
| 主分类号： | G16B5/00 | 分类号： | G16B5/00;G16B20/20;G16B50/00 |
| 代理公司： | 上海旭诚知识产权代理有限公司 31220 | 代理人： | 郑立 |
| 地址： | 200240 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种降低单细胞转录组数据中技术噪声的方法，包括以下步骤：步骤一，根据单细胞转录组数据获取每个基因表达的平均方差；步骤二，根据所述每个基因表达的平均方差构建卡方分布模型并使用所述卡方分布模型计算多个候选阈值；步骤三，计算使用每个所述候选阈值时所得到的有效特征向量的个数；步骤四，基于所述有效特征向量的个数判定基因滤除的最优阈值；步骤五，基于所述最优阈值进行基因滤除。本发明的降低单细胞转录组数据中技术噪声的方法，可以平衡单细胞转录组数据预处理中控制残留噪声和减小信息损失之间的矛盾，并且基于统计最优化原则降低噪声，摒除人为干扰因素，显著提高了单细胞数据解读的可靠性。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 降低 单细胞 转录 数据 技术 噪声 方法 | ||
【主权项】：
1.一种降低单细胞转录组数据中技术噪声的方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤一，根据单细胞转录组数据获取每个基因表达的平均方差；步骤二，根据所述每个基因表达的平均方差构建卡方分布模型并使用所述卡方分布模型计算多个候选阈值；步骤三，计算使用每个所述候选阈值时所得到的有效特征向量的个数；步骤四，基于所述有效特征向量的个数判定基因滤除的最优阈值；步骤五，基于所述最优阈值进行基因滤除。
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