[发明专利]一种自动化判定结核分枝杆菌基因突变的方法

摘要

本申请涉及一种自动化判定结核分枝杆菌基因突变的方法，其包括首先截取各PCR曲线扩增段的曲线特征，然后通过对其自身求卷积来放大它们之间的差异，以纵坐标最小的曲线为基准进行归一化，且通过最小二乘法计算各曲线的平均斜率。然后选定平均斜率最大的曲线作为阴性对照曲线，以0值曲线作为阳性对照曲线，对于其它各条曲线而言，则分别计算该条曲线与阴性对照曲线以及阳性对照曲线之间的差异，并由此得到该条曲线的阴性概率和阳性概率。如果阳性概率大于阴性概率，则判定该曲线为阳性。本申请的有益效果在于阴性模型和阳性模型均无需外部输入，仅仅识别阴性曲线的扩增期，并截取其它曲线在同一时期的曲线即可，可实现自动化判定结核分枝杆菌基因突变。

主权项

1.一种自动化判定结核分枝杆菌基因突变的方法，所述方法包括下述步骤：S1：截取至少3条结核分枝杆菌核酸荧光PCR曲线扩增段的曲线特征，得到至少3条扩增段曲线；S2：放大所述至少3条扩增段曲线的曲线特征，得到至少3条放大的扩增段曲线；S3：以纵坐标值最小的曲线作为基准，对所述至少3条放大的扩增段曲线进行归一化，并分别计算每条放大的扩增段曲线的平均斜率；S4：以所述至少3条放大的扩增段曲线中平均斜率最大的曲线作为阴性对照曲线，以0值曲线作为阳性对照曲线，分别计算其它各条曲线与阴性对照线的差异Dneg以及分别计算其它各条曲线与阳性对照线的差异Dpos，以及基于上述差异来分别计算各条曲线的阴性概率Rneg和阳性概率Rpos；以及S5：自动判断检测样品是否发生结核分枝杆菌基因突变，如果所有曲线的阴性概率Rneg大于阳性概率Rpos，则表明该检测样品没有发生结核分枝杆菌基因突变；如果有任一曲线的阴性概率Rneg小于阳性概率Rpos，则表明该检测样品发生结核分枝杆菌基因突变；其中在步骤S3中，对于除了阴性对照曲线以外的每一条曲线，通过下述公式(100)来计算其阴性概率Rneg；和/或，通过下述公式(200)来计算其阳性概率Rpos：以及