[发明专利]一种使用高通量DNA杂交芯片的人类Y染色体SNP分型方法在审
| 申请号： | 201810686653.8 | 申请日： | 2018-06-28 |
| 公开（公告）号： | CN108841968A | 公开（公告）日： | 2018-11-20 |
| 发明（设计）人： | 陈宁;王翠红;梁冰冰;赵南 | 申请（专利权）人： | 北京水母科技有限公司 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12Q1/6837;C12Q1/6858 |
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| 地址： | 100176 北京市大兴区经济*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种使用高通量DNA杂交芯片的人类Y染色体SNP分型方法，基于Y染色体SNP检测需求，进行位点同源性比对，同时对比数据库中已验证位点；根据设计好的芯片进行生产；将从受试者处采集的唾液或口腔拭子样本进行gDNA的提取；根据Axiom芯片检测流程，自动化进行芯片制备；使用GeneTitan MC仪器对制备好的基因芯片进行扫描；使用软件对基因芯片扫描结果进行分析，计算各检测SNP位点的基因型；基于检测得到的SNP分型结果，根据ISOGG Y‑DNA树计算Y‑DNA单倍群。本发明杂交SNP芯片在Y染色体的应用具有核酸制备、检测成本低，SNP定制位点灵活，测出率高，降低了原有对家族、姓氏等研究中由于改姓、入赘等带来的结果的不确定性，实验检测所需的gDNA量较低，检测成本更低。 | ||
| 搜索关键词： | 位点 检测 基因芯片 芯片 高通量 对比数据库 同源性比对 不确定性 核酸制备 扫描结果 实验检测 芯片检测 芯片制备 基因型 唾液 拭子 制备 姓氏 口腔 样本 扫描 自动化 验证 杂交 采集 灵活 应用 分析 生产 研究 | ||
【主权项】：
1.一种使用高通量DNA杂交芯片的人类Y染色体SNP分型方法，其特征在于：包括如下步骤：步骤一：位点筛选；步骤二：芯片Y染色体SNP定制、实验、分析、单倍群计算，包括芯片定制设计：基于Y染色体SNP检测需求，进行位点同源性比对，同时对比数据库中已验证位点，优化芯片设计方案；芯片生产：根据设计好的芯片进行生产；步骤三：基因芯片基因分型实验，包括DNA提取：将从受试者处采集的唾液或口腔拭子样本进行gDNA的提取；芯片制备：根据Axiom芯片检测流程，自动化进行芯片制备；芯片扫描：使用GeneTitan MC仪器对制备好的基因芯片进行扫描；步骤四：生信分析、单倍群计算，包括生信分析：使用软件对基因芯片扫描结果进行分析，计算各检测SNP位点的基因型；单倍群计算：基于检测得到的SNP分型结果，根据ISOGG Y‑DNA树计算Y‑DNA单倍群，出具报告。
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