[发明专利]一种小鼠前额叶神经元双光子荧光图像的自动分割方法在审
申请号: | 201810642767.2 | 申请日: | 2018-06-21 |
公开(公告)号: | CN110097552A | 公开(公告)日: | 2019-08-06 |
发明(设计)人: | 陆洋;周专;周博;李明立;王伦;王庆龙;陈国庆;孙立媛;孙素华 | 申请(专利权)人: | 北京大学 |
主分类号: | G06T7/10 | 分类号: | G06T7/10 |
代理公司: | 北京万象新悦知识产权代理有限公司 11360 | 代理人: | 苏爱华 |
地址: | 100871*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明涉及一种小鼠前额叶神经元双光子荧光图像的自动分割方法,包含了采集神经元双光子图像数据部分、图像数据增强并采用带模糊边界的实例标注方法得到若干子图及标注集合部分、通过带残差网络微结构的多尺度特征融合框架实现神经元自动分割部分以及通过形态学后处理得到输出分割结果部分。本发明能够实时分割由双光子荧光显微镜采集的小鼠前额叶神经元活动的成像数据,对神经生物学研究的数据分析具有潜在价值。 | ||
搜索关键词: | 神经元 双光子荧光 自动分割 前额叶 小鼠 图像数据 标注 神经生物学研究 形态学 采集 图像 多尺度特征 神经元活动 网络微结构 后处理 成像数据 分割结果 模糊边界 数据分析 双光子 残差 显微镜 集合 输出 融合 分割 | ||
【主权项】:
1.一种小鼠前额叶神经元双光子荧光图像的自动分割方法,其特征在于,由以下步骤组成:1)采集使用钙离子指示剂染色的小鼠前额叶神经元双光子图像数据;2)将采集到的图像数据进行图像增强处理;3)将图像增强处理后的数据使用带模糊边界的实例标注方法得到L个子图及标注集合;4)训练L个子图及标注集合得到图像分割网络模型M;5)将新采集得到小鼠前额叶神经元双光子图像通过训练好的网络模型M进行自动分割;6)将网络模型M的分割结果通过形态学后处理得到最终分割结果。
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