[发明专利]一种评估组装基因序列的准确性的方法有效
申请号: | 201810487929.X | 申请日: | 2018-05-21 |
公开(公告)号: | CN108647494B | 公开(公告)日: | 2021-05-11 |
发明(设计)人: | 邓天全;高强;杨林峰 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因科技服务有限公司 |
主分类号: | G16B30/20 | 分类号: | G16B30/20;C40B50/06 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 518303 广东省深圳市盐田区*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 本发明公开了一种评估组装基因序列的准确性的方法。该方法包括如下步骤:取覆盖待评估的组装基因序列的DNA,制备不同长度插入片段的双末端测序文库;双末端测序文库和组装基因序列进行双端比对,在组装基因序列上将双端比对上的位置用抛物线连接,如果组装基因序列的区域均被3条以上的抛物线覆盖,则组装基因序列准确;否则组装基因序列不准确。对标准序列的结构是否连贯及其本身的准确性进行评估和校验非常必要,存在一定的错误的标准序列不能用于评估基因组组装序列。实验证明,采用本发明提供的方法可以评估标准序列的准确性。本发明具有重大的应用价值。 | ||
搜索关键词: | 一种 评估 组装 基因 序列 准确性 方法 | ||
【主权项】:
1.一种评估组装基因序列的准确性的方法,包括如下步骤:(a1)取覆盖待评估的组装基因序列的DNA,制备不同长度插入片段的双末端测序文库;(a2)完成步骤(a1)后,双末端测序文库和组装基因序列进行双端比对,在组装基因序列上将双端比对上的位置用抛物线连接,如果组装基因序列的区域均被3条以上的抛物线覆盖,则组装基因序列准确;否则组装基因序列不准确。
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