[发明专利]一种直扩RPA现场可视化检测方法在审

专利信息
申请号: 201810447842.X 申请日: 2018-05-11
公开(公告)号: CN108359717A 公开(公告)日: 2018-08-03
发明(设计)人: 赵凯;范小瑞;赵笑;杜亚楠;张琪;张晓霞;吴文静;张皖静;赵庆;史斌;赵桓震;赵斌安;潘磊 申请(专利权)人: 上海市农业科学院
主分类号: C12Q1/6844 分类号: C12Q1/6844;C12Q1/6895;C12Q1/689;C12Q1/14;C12N15/11
代理公司: 上海开祺知识产权代理有限公司 31114 代理人: 崔兆慧;费开逵
地址: 201106 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 一种直扩RPA现场可视化检测方法,包括如下步骤:1)粗提待测样品基因组DNA;2)针对目的基因设计RPA特异性引物;3)将RPA特异性引物加入到RPA反应体系中进行RPA扩增反应,所述RPA反应体系中成分的终浓度为:外引物F 0.12‑0.48μM,内引物R 0.12‑0.48μM,dNTPs1.4‑1.8mM,MgOAc 8.4‑14mM,模板DNA 1~2μL;反应程序:32‑42℃,5‑10min;4)鉴定扩增结果:向扩增产物中加入SYBR Green I染料,直接在日光灯或者阳光下观察颜色变化:显色为绿色的样品为阳性;显色为橘色的样品为阴性。本发明可应用于来源于动物、植物、微生物的所有基因进行RPA检测,对RPA扩增产物实现了快速、简便、可视化鉴定。
搜索关键词: 可视化检测 特异性引物 扩增产物 显色 日光灯 基因组DNA 待测样品 反应程序 扩增反应 目的基因 颜色变化 模板DNA 可视化 内引物 外引物 染料 粗提 扩增 阴性 橘色 微生物 基因 检测 观察 应用
【主权项】:
1.一种直扩RPA现场可视化检测方法,包括如下步骤:1)粗提待测样品基因组DNA;2)针对目的基因设计用于RPA检测的特异性引物,所述特异性引物包括外引物F和内引物R;3)将步骤1)粗提的基因组DNA作为模板,步骤2)设计的RPA特异性引物加入到RPA反应体系中,进行RPA扩增反应;所述RPA反应体系包含外引物F、内引物R、dNTPs、MgOAc、模板DNA,成分的终浓度为:外引物F 0.12‑0.48μM,内引物R 0.12‑0.48μM,dNTPs 1.4‑1.8mM,MgOAc 8.4‑14mM,模板DNA 1~2μL;RPA扩增反应程序为:32‑42℃,5‑10min;RPA扩增反应程序中反应温度优选36‑42℃;4)鉴定扩增结果步骤3)RPA扩增反应结束后,向扩增产物中加入SYBR Green I染料,直接在日光灯或者阳光下观察颜色变化:显色为绿色的样品为阳性;显色为橘色的样品为阴性。
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