[发明专利]与非洲稻落粒相关的插入缺失片段及其应用

摘要

本发明公开了一种与非洲稻落粒相关的插入缺失片段及其应用。本发明提供了用于鉴定或辅助鉴定水稻落粒性的成套引物，由引物对1(SEQ ID No.3和SEQ ID No.4)和引物对2(SEQ ID No.5和SEQ ID No.6)组成。本发明在非洲栽培稻中发现包含有SH3基因在内的45k插入缺失片段(SEQ ID No.1的第161‑45560位)与非洲稻落粒程度密切相关。该插入缺失片段未缺失类型的落粒性大于插入缺失片段缺失类型的落粒性。本发明对于筛选和培育落粒性适中的非洲稻新品种具有重要意义。

主权项

1.用于鉴定或辅助鉴定水稻落粒性的成套引物，由引物对1和引物对2组成：所述引物对1为如下(a1)‑(a3)中任一所示的引物对：(a1)由SEQ ID No.3所示的单链DNA和SEQ ID No.4所示的单链DNA组成的引物对；(a2)由将SEQ ID No.3和SEQ ID No.4经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(a1)中所述引物对功能相同的引物对；(a3)由经SEQ ID No.1的第161‑45560位所示核苷酸序列设计所得的引物对，且与(a1)中所述引物对功能相同的引物对；所述引物对2为如下(b1)‑(b3)中任一所示的引物对：(b1)由SEQ ID No.5所示的单链DNA和SEQ ID No.6所示的单链DNA组成的引物对；(b2)由将SEQ ID No.5和SEQ ID No.6经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加后所得序列所示的两条单链DNA分子组成的，且与(b1)中所述引物对功能相同的引物对；(b3)由经SEQ ID No.2所示核苷酸序列设计所得的引物对，且与(b1)中所述引物对功能相同的引物对。