[发明专利]染色质相互作用差异的分析方法和系统有效
| 申请号： | 201810069870.2 | 申请日： | 2018-01-24 |
| 公开（公告）号： | CN108197431B | 公开（公告）日： | 2022-04-05 |
| 发明（设计）人： | 陈阳;那第尔;张奇伟 | 申请（专利权）人： | 清华大学 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00 |
| 代理公司： | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人： | 彭鲲鹏;韩宏星 |
| 地址： | 100084*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种不同状态的样品中染色质相互作用差异的分析方法，更具体涉及一种结合近邻相互作用的信息进行差异性染色质相互作用分析的方法。 | ||
| 搜索关键词： | 染色质 相互作用 差异 分析 方法 系统 | ||
【主权项】：
1.一种用于分析不同状态的样品中染色质相互作用差异的方法，其包括下列步骤：(1)分别对处于第一状态和第二状态的样品进行染色质相互作用的分析；(2)根据作用染色质区段对在第一状态和第二状态的样品间的接触强度差异以及邻居染色质区段对之间的接触强度差异，分析得到在不同状态的样品中具有差异的染色质相互作用，所述作用染色质区段对是指经过染色质相互作用分析被鉴定实际发生染色质相互作用的染色质区段对，其包括至少两个作用染色质区段；所述邻居染色质区段对是由邻居染色质区段两两组合形成的，所述邻居染色质区段是指发生相互作用的两个染色质区段各自所临近的染色质区段，由于作用染色质区段对的关系，作用染色质区段附近的染色质区段之间的空间距离也被拉近而产生染色质接触的信号；优选的，步骤(1)的染色质相互作用分析重复进行nc次实验，其中c＝1或2，n1表示针对第一状态的样品重复的次数，n2表示针对第二状态的样品重复的次数，n1和n2相等或不相等，nc是1‑100之间的自然数，例如1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19或20，优选2、3、4或5。
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