[发明专利]分子状态机在审

专利信息
申请号: 201780041484.6 申请日: 2017-06-29
公开(公告)号: CN109415725A 公开(公告)日: 2019-03-01
发明(设计)人: K·K·甘贾姆 申请(专利权)人: 微软技术许可有限责任公司
主分类号: C12N15/10 分类号: C12N15/10;C12N15/90;C12Q1/6869;C12Q1/6897;G06N3/12
代理公司: 北京市金杜律师事务所 11256 代理人: 陈文平;袁元
地址: 美国华*** 国省代码: 美国;US
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摘要: 通过设计细胞以使用特异性同源定向修复(“HDR”)模板,基于细胞的当前“状态”修复多核苷酸中的双链断裂,在细胞中实施分子状态机。可以通过细胞中分子的存在或通过细胞的多核苷酸中特定切割位点的可用性来建立状态。可以使用不同的HDR模板或不同的核酸酶来基于状态执行HDR。当状态改变时,相同的信号或事件将导致将不同的HDR模板引入细胞的现有多核苷酸中。可以使用细胞内部或外部的信号改变细胞的状态。细胞可以基于状态产生分子事件的日志,存储二进制数据,或执行其他合成生物学/分子计算功能。
搜索关键词: 细胞 多核苷酸 分子状态 存储二进制数据 合成生物学 状态改变时 修复 分子计算 分子事件 切割位点 双链断裂 状态产生 状态执行 可用性 核酸酶 日志 同源 引入 外部
【主权项】:
1.一种在细胞中实施的分子状态机,其包括:工程化信号传导途径,其响应于与第一状态相关的第一信号产生跟踪分子;基于所述跟踪分子改变RNA产物的转录速率的操纵子;具有靶位点的双链多核苷酸;具有与所述靶位点的同源性的同源定向修复(HDR)模板,其中所述细胞中可用的所述HDR模板的量或配置成在所述靶位点的切割位点处产生双链断裂(DSB)的核酸酶的活性被所述RNA产物增加;和抑制系统,其减少所述细胞中可用的所述HDR模板的量或所述核酸酶的活性。
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