[发明专利]双色纳米孔测序

摘要

本发明涉及用于使用纳米孔和光学检测分析包含至少两种类型的单体的线性链的聚合物诸如多核苷酸包括DNA、RNA等的方法。在一些实施方案中，少至两种不同种类的核苷酸被不同的光学标记物标记，所述不同的光学标记物针对靶多核苷酸的有义链和反义链两者中的被选择种类的核苷酸生成可区分的光学信号。使标记的链易位通过纳米孔，其中链的核苷酸被限制为顺序地通过光学检测区，在所述光学检测区中，它们的标记物生成构成光学特征的光学信号的顺序。在一些实施方案中，将来自有义链和反义链两者的光学特征的信息组合以确定靶多核苷酸的完整核苷酸序列。

主权项

1.一种分析双链多核苷酸的方法，所述方法包括：拷贝双链多核苷酸的一条链，使得具有不同光学标记物的核苷酸类似物取代至少两种核苷酸，以形成标记的链；拷贝所述链的互补链，使得所述核苷酸类似物取代相同的至少两种核苷酸，以形成标记的互补链；使所述标记的链易位通过纳米孔，使得所述标记的链的核苷酸依次通过激发区，在所述激发区中光学标记物被激发以生成光学信号；当所述标记的链易位通过所述纳米孔时，检测来自所述光学标记物的光学信号的时间序列以产生链的光学特征；使所述标记的互补链易位通过纳米孔，使得所述标记的互补链的核苷酸依次通过激发区，在所述激发区中光学标记物被激发以生成光学信号；当所述标记的互补链易位通过所述纳米孔时，检测来自所述光学标记物的光学信号的时间序列以产生互补链的光学特征；由所述链的光学特征和所述互补链的光学特征确定所述双链多核苷酸的序列。