[发明专利]一种转录组参考的关联分析方法及其应用在审
| 申请号： | 201711319379.2 | 申请日： | 2017-12-12 |
| 公开（公告）号： | CN108004302A | 公开（公告）日： | 2018-05-08 |
| 发明（设计）人： | 刘头明;李富;朱四元 | 申请（专利权）人： | 中国农业科学院麻类研究所 |
| 主分类号： | C12Q1/6869 | 分类号： | C12Q1/6869;G06F19/18 |
| 代理公司： | 北京超凡志成知识产权代理事务所(普通合伙) 11371 | 代理人： | 史晶晶 |
| 地址： | 410205 湖南省长沙市岳麓*** | 国省代码： | 湖南;43 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种转录组参考的关联分析方法，包括：1).建立一个参考群体并将所述参考群体的所有个体的转录组序列测通得到参考转录本；2).对预测群体进行高通量RNA测序，并将所得到的测序数据与所述参考转录本进行比对拼接，得到群体转录组测序结果；3).由所述群体转录组测序结果中分析得到群体SNP的数据，利用所述群体SNP与感兴趣的性状进行关联分析，确定目标基因所在区域；再利用目标区域的基因表达变异与性状进行关联，得到目标性状的候选基因。与GWAS相比，转录组测序便宜、快速且不受基因组复杂性所限制。该技术理论上可以实现在所有物种中开展性状关联分析，无论该物种有无参考基因组、基因组是否很复杂。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 转录 参考 关联 分析 方法 及其 应用 | ||
【主权项】：
1.一种转录组参考的关联分析方法，其特征在于，包括：1).建立一个参考群体并将所述参考群体的所有个体的转录组序列测通得到参考转录本；2).对预测群体进行高通量RNA测序，并将所得到的测序数据与所述参考转录本进行比对拼接，得到群体转录组测序结果；3).由所述群体转录组测序结果中分析得到群体SNP的数据，利用所述群体SNP与感兴趣的性状进行关联分析，确定目标基因所在区域；再利用目标区域的基因表达变异与性状进行关联，得到目标性状的候选基因。
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